上海气相色谱仪所能直接分离的样品是可挥发、且热稳定的，沸点一般不超过500℃。据有关资料统计，在目前已知的化合物中，有20%～25%可用上海气相色谱仪直接分析，其余原则上均可用液相色谱仪分析。也就是说上海气相色谱仪的分析对象远没有液相色谱仪多。需要指出的是，有些虽然不能用气相色谱法直接分析的样品，通过特殊的进样技术，如顶空进样和裂解进样，也可用气相色谱法间接分析。比如高分子材料的裂解色谱就是如此。这在一定程度上扩大了气相色谱法分析对象的范围。此外，气相色谱法比液相色谱更适合于*气体的分析。
上海气相色谱仪具有分离能力好，灵敏度高，分析速度快，操作方便等优点，但是受技术条件的限制，沸点太高的物质或热稳定性差的物质都难于应用气相色谱法进行分析。一般对500℃以下不易挥发或受热易分解的物质部分可采用衍生化法或裂解法。液相色谱法，只要求试样能制成溶液，而不需要气化，因此上海气相色谱仪不受试样挥发性的限制。对于高沸点、热稳定性差、相对分子量大(大于 400 以上)的有机物( 些物质几乎占有机物总数的 75% ～ 80% )原则上都可应用液相色谱法来进行分离、分析。 据统计，在已知化合物中，能用气相色谱分析的约占20%，而能用液相色谱分析的约占70～80%。
上海气相色谱仪如何选用不同气体纯度的气源做载气和辅助气体，目前很难找到有关这方面的综合资料，上海气相色谱仪选择什么样的气体纯度是个问题。根据每一家用户具体使用的哪一类(高、中、低档)仪器，选择什么样纯度的气体，确实是一个比较复杂的问题。原则上讲，选择气体纯度时，主要取决于：①分析对象；②色谱柱中填充物；③检测器。我们建议在满足分析要求的前提下，尽可能选用纯度较高的气体。上海气相色谱仪这样不但会提高(保持)仪器的高灵敏度，而且会延长色谱柱、色谱仪(气路控制部件、气体过滤器)的寿命。实践证明，作为中仪器，长期使用较低纯度的气体气源，一旦要求分析低浓度、高精度要求的样品时，要想恢复仪器的高灵敏度是十分困难的。而对于低档仪器，作常量或半微量分析，选用高纯度的气体，上海气相色谱仪会增加运行成本，有时还增加了气路的复杂性，因此选用气体的纯度要求达到或略高于仪器自身对气体纯度的要求即可，这样既可以达到工作要求，又能延长仪器的寿命，还不至于增加仪器的运行成本。
一般说来，痕量分析或毛细管色谱的载气纯化程度，要高于常规分析。特别是电子捕获、热导池检测器，载气纯度直接影响灵敏度和稳定性，一定要严格净化。新上海气相色谱仪接入气源时一定要做到心中有数，决不能随意接入，否则会造成色谱柱失效、检测器寿命缩短、甲烷化装置等的损坏、信噪比减小得无法使用等，zui终导致分析数据严重失真，失去了分析的意义，为工作带来严重的损失。上海气相色谱仪操作不同检测器推荐使用的气体纯度，我们推荐气体纯度的技术要求，通常用于常规分析，对于特殊高灵敏度的痕量分析应采用高一级纯度的气体，如果不在意色谱柱和仪器的使用寿命，或分析样品组分浓度很高时，也可以不使用过高纯度的气体，由于各个制气厂设置不同，其杂质含量将有所不同；为满足不同的使用要求，上海气相色谱仪选用不同厂家不同纯度的气源后，可以通过气体净化处理满足分析要求，对于不同杂质的气体采用何种净化方法和装置，留待以后再加以讨论。
上海气相色谱仪一般用于定量和定性分析外，还能测定样品在固定相上的分配系数、活度系数、分子量和比表面积等物理化学常数。总结来说，上海气相色谱仪是一种对混合气体中各组成分进行分析检测的仪器。上海气相色谱仪在石油、化工、生物化学、医药卫生、食品工业、环保等方面应用很广。
